Titulo:
Estandarización de protocol de extracción de adn genomico de Podocnemis expansa e testes con los marcadores rapd e issr
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Sumario:
Este trabajo tuvo como objetivo comparar y estandarizar un protocolo eficiente para la extracción de ADN de fragmentos de tejido de Podocnemis expansa y evaluar el poder informativo de los marcadores moleculares RAPD e ISSR para el análisis de la estructura genética de la especie colectada en el entorno del parque Nacional do Araguaia, Tocantins, Brasil. El método de extracción fue estandarizado a partir de la evaluación de tres diferentes protocolos permitiendo la obtención de ADN de buena calidad y en cantidad adecuada para las reacciones de RAPD e ISSR. La razón A de las muestras presentó un valor entre 1.8 a 2.3, indicando que estas presentan baja contaminación por proteínas y que los ADNs podrían ser utilizados para evaluar el poder... Ver más
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Estandarización de protocol de extracción de adn genomico de Podocnemis expansa e testes con los marcadores rapd e issr STANDARDIZATION OF PROTOCOL FOR DNA EXTRACTION OF Podocnemis expansa AND TESTS WITH RAPD AND ISSR MARKERS Este trabajo tuvo como objetivo comparar y estandarizar un protocolo eficiente para la extracción de ADN de fragmentos de tejido de Podocnemis expansa y evaluar el poder informativo de los marcadores moleculares RAPD e ISSR para el análisis de la estructura genética de la especie colectada en el entorno del parque Nacional do Araguaia, Tocantins, Brasil. El método de extracción fue estandarizado a partir de la evaluación de tres diferentes protocolos permitiendo la obtención de ADN de buena calidad y en cantidad adecuada para las reacciones de RAPD e ISSR. La razón A de las muestras presentó un valor entre 1.8 a 2.3, indicando que estas presentan baja contaminación por proteínas y que los ADNs podrían ser utilizados para evaluar el poder informativo de los marcadores RAPD e ISSR. Los dos marcadores demostraron ser una herramienta eficiente para estudios genéticos de P. expansa This study aims to compare and standardize an effective protocol for DNA extraction from tissue of Podocnemis expansa and test the informative power of RAPD and ISSR markers to analyze the genetic structure of species collected in the vicinity the National Park Araguaia, Tocantins, Brazil. The extraction method was standardized by the test with three different protocols and allowed the acquisition of DNA with good quality and in adequate quantities for there actions of RAPD and ISSR. The A260/AA280 ratio of the samples showed a value between 1.8 to 2.3 indicating that they had low contamination by proteins and the DNA could be used to test the in formative power of the RAPD and ISSR markers. The two markers proved to be an efficient tool for genetic studies of P.expansa. OLIVEIRA, DEYLA PAULA DIAS-OLIVEIRA, Mestre DAS DORES, JAQUELINE MALVASIO, ADRIANA WALDESSE PIRAGÉ, OLIVEIRA-JUNIOR DNA extraction Podocnemis expansa molecular markers extracción de ADN Podocnemis expansa marcadores moleculares 4 2 Núm. 2 , Año 2012 : RECIA 4(2):JULIO-DICIEMBRE Artículo de revista Journal article 2012-07-05T00:00:00Z 2012-07-05T00:00:00Z 2012-07-05 application/pdf Universidad de Sucre Revista Colombiana de Ciencia Animal - RECIA 2027-4297 https://revistas.unisucre.edu.co/index.php/recia/article/view/210 10.24188/recia.v4.n2.2012.210 https://doi.org/10.24188/recia.v4.n2.2012.210 spa https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ 279 290 ARAS, S.; DURAN A.; YENILMEZ, G. 2003. Isolation of DNA for RAPD analysis from dry leaf material of some Hesperis L. specimens. Plant Molecular Biology Reporter 21:461a-461. ESCALONA, T.; FÁ, J.E. 1998. Survival of nests of the terecay turtle (Podocnemis unifilis) in the Nichare-Tawadu Rivers, Venezuela. Journal of Zoology 244:303-312. FERREIRA, M. E.; GRATTAPAGLIA, D. 1998. Introdução ao uso de marcadores moleculares em análise genética. 3. ed. Brasília: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, Brasil. GALVÃO, S.B. 2007. Aspectos da biologia, criações comerciais e do consumo de quelônios no estado do Tocantins: alternativas de manejo e sustentabilidade. 2007. Monografia Bacharel em Engenharia Ambiental. Universidade Federal do Tocantins, Brasil. GUPTA, M.; CHYI, Y.S.; ROMERO-SEVERSON, J.; OWEN, J.L. 1994. Amplification of DNA markers from evolutionarily diverse genomes using single primer of simple sequence repeats. Theor. Appl. Genet. 89:998-1006. INNIS, M.A.; GELFAND, D.H.; SNINSKY, J.J.; WHITE, T.J. 1990. PCR protocols: a guide to methods and applications. Academic Press, San Diego, USA. INSTITUTO BRASILEIRO DO MEIO AMBIENTE E DOS RECURSOS NATURAIS RENOVAVEIS-IBAMA. 1989. Projetos Quelônios da Amazônia: Manual Técnico-BAMA. Brasília, Brasil. LACERDA, D.R.; ACEDO, M.D.P.; LEMOS-FILHO, J.P.; LOVATO, M.B. 2002. A técnica de RAPD: uma ferramenta molecular em estudos de conservação de plantas. Lundiana 3(2):87-92. LUZ, V.L.F. 2005. Criação comercial de tartaruga e tracajá: manual técnico. SEBRAE. Cuiabá; Brasil MALVASIO, A; SALERA-JUNIOR, G. 2004. Entrevista com a equipe do Projeto Quelônios da Ilha do Bananal. Terras indígenas e Unidades de Conservação da Natureza, Brasil. PECCININI-SEALE, D. 2002. Técnicas citogenéticas, enzimáticas e moleculares. Em: Técnicas de coleta e preparação de vertebrados. São Paulo: Arujá Instituto Pau Brasil de História Natural, Brasil. PEZZUTI, J.C.B. 2003. Ecologia e Etnoecologia de Quelônios no Parque Nacional do Jaú, Amazonas, Brasil. Tese, Universidade Estadual de Campinas, São Paulo, Brasil. PRITCHARD, P.C.H.; TREBBAU, P. 1984. The Turtles of Venezuela. S.1p. Society for the Study of Amphibians and Reptiles. USA. PORTELINHA, T.C.G. 2007. Estudo das populações de Podocnemis expansa e Podocnemis unifilis no Rio Javaés, Tocantins. Monografia Bacharel em Engenharia Ambiental. Universidade Federal do Tocantins, Brasil. REDDY, M.P.; SARLA, N.; SIDDIQ, E.A. 2002. Inter simple sequence repeat (ISSR) polymorphism and its application inplant breeding. Euphytica 128:9-17. SAMBROOK, J.; FRITSCHI, E.F.; MANIATIS, T. 1989. Molecular cloning: a laboratory manual. New York Cold Spring Harbor Laboratory Press, USA. SALERA-JUNIOR, G.; MALVASIO, A.; PORTELINHA, T.C.G. 2009. Avaliação de padrão irregular dos escudos do casco em Podocnemis expansa e Podocnemis unifilis (Testudines, Podocnemididae). Acta Amazonica 39(2):429436. SALERA-JUNIOR, G.; MALVASIO, A.; GIRALDIN, O. 2006. Relações cordiais. Ciência Hoje 39(226):61-63. TSUMURA,Y.; OHBA, K.; STRAUSS, S.H. 1996. Diversity and inheritance of inter-simple sequence repeat polymorphisms in Douglasfir (Pseudotsuga menziesii) and sugi (Cryptomeria japonica). Theor Appl Genet. 92:40-45. ROMANO, E.; BRASILEIRO, A.C.M. 1999. Extração de DNA de plantas. Biotecnologia 2(9):40-43. WEEDEN, N.F., TIMMERMAN., G.M.; HEMMAT, M.; KNEEN, B.E., LODHI, M. A. 1992. Inheritance and reliability of RAPD markers. Págs: 12-17. Em: Applications of RAPD technology to plant breeding, Joint Plant Breeding. Symposia Series, Minneapolis, USA. WELSH, J.; McCLELLAND, M. 1990. Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers. 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This study aims to compare and standardize an effective protocol for DNA extraction from tissue of Podocnemis expansa and test the informative power of RAPD and ISSR markers to analyze the genetic structure of species collected in the vicinity the National Park Araguaia, Tocantins, Brazil. The extraction method was standardized by the test with three different protocols and allowed the acquisition of DNA with good quality and in adequate quantities for there actions of RAPD and ISSR. The A260/AA280 ratio of the samples showed a value between 1.8 to 2.3 indicating that they had low contamination by proteins and the DNA could be used to test the in formative power of the RAPD and ISSR markers. The two markers proved to be an efficient tool for genetic studies of P.expansa.
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