Titulo:
Diversidad genética en una población de maíz criollo (Zea mays L.) evaluada mediante marcadores microsatélites en Puerto Libertador, Córdoba
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Sumario:
El maíz una planta de origen mesoamericano, se ha desarrollado en los más variados microambientes, lo que ha generado una gran diversidad de variedades alrededor del mundo. Con el objetivo de determinar la diversidad genética de una población de maíz criollo, se evaluaron doce marcadores microsatélite, en 30 accesiones, en Puerto Libertador, Córdoba. El ADN de cada accesión fue extraído, mediante el kit de PROMEGA; los marcadores se amplificaron, mediante la técnica de PCR y los amplicones, se corrieron en geles de poliacrilamida. Los geles fueron digitalizados y los tamaños moleculares se determinaron, mediante un modelo exponencial. Los resultados mostraron un total de 66 alelos y un promedio de alelos de 5,5; la heterocigosidad esperada... Ver más
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0123-4226
2619-2551
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2019-12-31
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Revista U.D.C.A Actualidad & Divulgación Científica - 2018
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Diversidad genética en una población de maíz criollo (Zea mays L.) evaluada mediante marcadores microsatélites en Puerto Libertador, Córdoba Genetic diversity in a population of creole maize (Zea mays L.) evaluated by microsatellite markers in Puerto Libertador, Córdoba El maíz una planta de origen mesoamericano, se ha desarrollado en los más variados microambientes, lo que ha generado una gran diversidad de variedades alrededor del mundo. Con el objetivo de determinar la diversidad genética de una población de maíz criollo, se evaluaron doce marcadores microsatélite, en 30 accesiones, en Puerto Libertador, Córdoba. El ADN de cada accesión fue extraído, mediante el kit de PROMEGA; los marcadores se amplificaron, mediante la técnica de PCR y los amplicones, se corrieron en geles de poliacrilamida. Los geles fueron digitalizados y los tamaños moleculares se determinaron, mediante un modelo exponencial. Los resultados mostraron un total de 66 alelos y un promedio de alelos de 5,5; la heterocigosidad esperada fue 0,655. Los valores del contenido de información polimórfica (PIC) variaron de 0,352 a 0,838, con un promedio de 0,592 y la prueba de Hardy-Weinberg mostró desequilibrio (p<0,05). Este trabajo reveló que las accesiones de maíz criollo estudiadas mostraron alto grado de polimorfismo, alta variabilidad genética y los marcadores microsatélites resultaron los apropiados para la evaluación de la diversidad genética. Esta información muestra ser útil para la conservación de la diversidad genética del maíz criollo estudiado y su protección. Maize a plant of Mesoamerican origin, has evolved in different microenvironments, generating the great diversity of maize that exists in the world. In order to determine the genetic diversity of a population of Creole maize, twelve microsatellite markers were evaluated in 30 accessions, in Puerto Libertador, Córdoba. The DNA of each accession was extracted using the PROMEGA kit, the markers were amplified by the PCR technique and the amplicons were run on polyacrylamide gels, the gels were digitalized and the molecular sizes were determined by an exponential model. Results showed a total of 66 alleles and an average of alleles of 5.5, the expected heterozygosity was 0.655, the values of the polymorphic information content (PIC) ranged from 0.352 to 0.838, with an average of 0.592 and the Hardy-Weinberg equilibrium showed imbalance (p <0.05). This work revealed that the studied accessions of Creole maize showed a high degree of polymorphism, high genetic variability and microsatellite markers were the appropriate for the evaluation of genetic diversity. This information shows to be useful for the conservation and protection of the genetic diversity of the studied Creole Maize. Pardo Pérez, Enrique Cavadía Martínez, Teodora Herrera Vanegas, Yurany Alelos diversidad genética heterocigosidad equilibrio Hardy-Weinberg Alleles Genetic Diversity heterozygosity corn Hardy-Weinberg equilibrium 21 2 Núm. 2 , Año 2018 :Revista U.D.C.A Actualidad & Divulgación Científica. Julio-Diciembre Artículo de revista Journal article 2018-12-31T00:00:00Z 2018-12-31T00:00:00Z 2019-12-31 application/pdf application/xml Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales U.D.C.A Revista U.D.C.A Actualidad & Divulgación Científica 0123-4226 2619-2551 https://revistas.udca.edu.co/index.php/ruadc/article/view/981 10.31910/rudca.v21.n2.2018.981 https://doi.org/10.31910/rudca.v21.n2.2018.981 eng https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ Revista U.D.C.A Actualidad & Divulgación Científica - 2018 359 365 ABRÀMOFF, D.; MAGALHAES, P.; RAM, S. 2004. Image processing with Image J. Biophotonics Intern. (EEUU). 11(7):36-42. ADEYEMO, O.; MENKIR, A.; MELAKU, G.; OMIDIJ, O. 2011. Genetic diversity assessment and relationship among tropical yellow endosperm maize inbred lines using SSR markers. Maydica (Italia). 56:1703-1709. AGUIRRE, V.J.; RINCÓN, F.; RAMÍREZ, R.; COLÓN, O.G.; RAZO, M.G. 2010. Modelo para la conservación de maíces criollos en el sureste de Coahuila; México. Coahuila; México. Editorial SINAREFI; Universidad Autónoma Agraria Antonio Narro. México. 49p. AL-BADEIRY, N.; AL-SAADI, A.; MERZA, T. 2014. Analysis of genetic diversity in maize (Zea mays L.) varieties using simple sequence repeat (SSR) markers. JUBPAS (Iraq). 6:1768-1774. BEDOYA, S.C.; MIR, C.; CHARCOSSET, A.; WARBURTON, M. 2010. Migración del maíz a partir de su centro de origen; evidencias históricas; genéticas y paleobotánicas. Segunda Edición. Bogotá; Colombia Editorial Mundi Prensa. 227p. BELLON, R.; AGUIRRE, J.; SMALE, M.; BERTHAUD, J.; ROSAS, M.; MENDOZA, J.; SOLANO, A.; MARTÍNEZ, R. 2004. Intervenciones participativas para la conservación de maíz en fincas en los Valles Centrales de Oaxaca; México. En: Chávez-Servia, J.L.; Tuxill, J.; Jarvis, D.I. (eds). Manejo de la diversidad de los cultivos en los agroecosistemas tradicionales. Instituto Internacional de recursos fitogenéticos. Cali; Colombia. p.118-123. BRACCO, M.; LIA, V.; POGGIO, L.; CÁMARA, J.; GOTTLIEB, A. 2013. Caracterización genética de razas de maíz autóctonas de Misiones; Argentina. Rev. Cienc. Tecnol. (Argentina). 20:52-60. CHEN, F.B.; YAO, Q.L.; LIU, H.F.; FANG, P. 2016. Evaluation on the germplasm of maize (Zea mays L.) landraces from southwest China. Genet. Mol. Res. (Brasil). 15(4):gmr15049160. EGUIARTE, L.; SOUZA, V.; AGUIRRE, X. 2007. Ecología Molecular. México D.F. México. Impresora y Encuadernadora Progreso. 609p. ELÇI, E.; HANÇER, T. 2015. Genetic analysis of maize (Zea mays L.) hybrids using microsatellite markers. J. Agric. Sci. 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Electronica (EEUU). 4(1):1-9. IGNJATOVIC-MICIC, D.; RISTIC, D.; BABIC, V.; ANDJELKOVIC, V.; VANCETOVIC, J. 2015. A simple SSR analysis for genetic diversity estimation of maize landraces. Genetika (Serbia). 47(1):53-62. KALINOWSKI, S.; WAGNER, A.; TAPER, M. 2007. Revising how the computer program CERVUS accommodates genotyping error increases success in paternity assignment. Mol. Ecol. (Inglaterra). 16(5):1099-1106. https://doi.org/10.1111/j.1365-294X.2007.03089.x MORA, F.; SAAVEDRA, J.; SILVA, T.; SCAPIM, C. 2013. Bayesian analysis of the genetic structure of a Brazilian popcorn germplasm using data from simple sequence repeats (SSR). Chil. J. Agric. Res. (Chile). 73(2):99-107. http://dx.doi.org/10.4067/S0718-58392013000200003 NEI, M. 1978. Estimation of average heterozygosity and genetic distance from a small number of individuals. Genetics (EEUU). 89:583-90. NYALIGWA, L.; HUSSEIN, S.; AMELEWOR, B.; GHEBREHIWO, H. 2015. Genetic diversity analysis of elite maize inbred lines of diverse sources using SSR markers. Maydica (Italia). 60:1-8. PEAKALL, R.; SMOUSE, P. 2006. Genalex 6: Genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research. Mol. Ecol. Notes. (Inglaterra). 6(1):288-295. https://doi.org/10.1111/j.1471-8286.2005.01155.x QIU, S.; CHEN, J.; LIN, S.; LIN, X. 2012. A comparison of silver staining protocols for detecting DNA in polyester backed polyacrylamide gel. Braz. J. Microbiol. (Brasil). 43(2):649-652. http://dx.doi.org/10.1590/S1517-83822012000200029 SALAMI, H.A.; SIKA, K.C.; PADONOU, W.; ALY, D.; YALLOU, C.; ADJANOHOUN, A.; KOTCHONI, S.; BABA-MOUSSA, L. 2016. Genetic diversity of maize accessions (Zea mays L.) cultivated from Benin using microsatellites markers. Amer. J. Mol. Biol. (EEUU). 6:12-24. http://dx.doi.org/10.4236/ajmb.2016.61002 SÁNCHEZ, I.; PÉREZ, E. 2014. Maíz I (Zea mays). Reduca (Biología). Serie Botánica (España). 7(2):151-171. SHARMA, B.; PRASANNA, M.; RAMESH, B. 2010. Analysis of phenotypic and microsatellite-based diversity of maize landraces in India; especially from the North East Himalaya region. Genetica (Holanda). 138:619-331. https://doi.org/10.1007/s10709-010-9436-1 TADEO, M.; ZAMUDIO, B.; ESPINOSA, A.; TURRENT, A.; CÁRDENAS, A.; LÓPEZ, C.; ARTEAGA, I.; VALDIVIA, R. 2015. Rendimiento de maíces nativos e híbridos en diferente fecha de siembra y sus unidades calor. Rev. Mex. Cienc. Agríc. (Mexico). 6(1):33-43. TSANG, V.; HANCOCK, K.; WILSON, M.; PALMER, D.F.; WHALEY, S.; MCDOUGAL, J.S.; KENNEDY, S. 1986. Enzyme-linked immune electro transfer blot technique (Western blot) for human T-lymphotropic virus type III/lymphadenopathy-associated virus (HTLV-III/LAV) antibodies. Centers for Disease Control. Procedural Guide. Atlanta; USA. Immunology Series No. 15. VAN, D.; MELCHINGER, A.; LEBRETON, C.; STICH, B. 2010. Population structure and genetic diversity in a commercial maize breeding program assessed with SSR and SNP markers. Theor. Appl. Genet. (Alemania). 120(7):1289-1299. https://dx.doi.org/10.1007%2Fs00122-009-1256-2 VIVODÍK, M.; PETROVIČOVÁ, L.; BALÁŽOVÁ, Ž.; GÁLOVÁ, Z. 2017. Genetic diversity of maize accessions (Zea Mays L.) cultivated from Europe using microsatellites markers. Agrobiodiversity (Ucrania) 1:524-528. http://dx.doi.org/10.4236/ajmb.2016.61002 https://revistas.udca.edu.co/index.php/ruadc/article/download/981/1481 https://revistas.udca.edu.co/index.php/ruadc/article/download/981/1678 info:eu-repo/semantics/article http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 http://purl.org/coar/resource_type/c_1843 info:eu-repo/semantics/publishedVersion http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 info:eu-repo/semantics/openAccess http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 Text Publication |
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El maíz una planta de origen mesoamericano, se ha desarrollado en los más variados microambientes, lo que ha generado una gran diversidad de variedades alrededor del mundo. Con el objetivo de determinar la diversidad genética de una población de maíz criollo, se evaluaron doce marcadores microsatélite, en 30 accesiones, en Puerto Libertador, Córdoba. El ADN de cada accesión fue extraído, mediante el kit de PROMEGA; los marcadores se amplificaron, mediante la técnica de PCR y los amplicones, se corrieron en geles de poliacrilamida. Los geles fueron digitalizados y los tamaños moleculares se determinaron, mediante un modelo exponencial. Los resultados mostraron un total de 66 alelos y un promedio de alelos de 5,5; la heterocigosidad esperada fue 0,655. Los valores del contenido de información polimórfica (PIC) variaron de 0,352 a 0,838, con un promedio de 0,592 y la prueba de Hardy-Weinberg mostró desequilibrio (p<0,05). Este trabajo reveló que las accesiones de maíz criollo estudiadas mostraron alto grado de polimorfismo, alta variabilidad genética y los marcadores microsatélites resultaron los apropiados para la evaluación de la diversidad genética. Esta información muestra ser útil para la conservación de la diversidad genética del maíz criollo estudiado y su protección.
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Maize a plant of Mesoamerican origin, has evolved in different microenvironments, generating the great diversity of maize that exists in the world. In order to determine the genetic diversity of a population of Creole maize, twelve microsatellite markers were evaluated in 30 accessions, in Puerto Libertador, Córdoba. The DNA of each accession was extracted using the PROMEGA kit, the markers were amplified by the PCR technique and the amplicons were run on polyacrylamide gels, the gels were digitalized and the molecular sizes were determined by an exponential model. Results showed a total of 66 alleles and an average of alleles of 5.5, the expected heterozygosity was 0.655, the values of the polymorphic information content (PIC) ranged from 0.352 to 0.838, with an average of 0.592 and the Hardy-Weinberg equilibrium showed imbalance (p <0.05). This work revealed that the studied accessions of Creole maize showed a high degree of polymorphism, high genetic variability and microsatellite markers were the appropriate for the evaluation of genetic diversity. This information shows to be useful for the conservation and protection of the genetic diversity of the studied Creole Maize.
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ABRÀMOFF, D.; MAGALHAES, P.; RAM, S. 2004. Image processing with Image J. Biophotonics Intern. (EEUU). 11(7):36-42. ADEYEMO, O.; MENKIR, A.; MELAKU, G.; OMIDIJ, O. 2011. Genetic diversity assessment and relationship among tropical yellow endosperm maize inbred lines using SSR markers. Maydica (Italia). 56:1703-1709. AGUIRRE, V.J.; RINCÓN, F.; RAMÍREZ, R.; COLÓN, O.G.; RAZO, M.G. 2010. Modelo para la conservación de maíces criollos en el sureste de Coahuila; México. Coahuila; México. Editorial SINAREFI; Universidad Autónoma Agraria Antonio Narro. México. 49p. AL-BADEIRY, N.; AL-SAADI, A.; MERZA, T. 2014. Analysis of genetic diversity in maize (Zea mays L.) varieties using simple sequence repeat (SSR) markers. JUBPAS (Iraq). 6:1768-1774. BEDOYA, S.C.; MIR, C.; CHARCOSSET, A.; WARBURTON, M. 2010. Migración del maíz a partir de su centro de origen; evidencias históricas; genéticas y paleobotánicas. Segunda Edición. Bogotá; Colombia Editorial Mundi Prensa. 227p. BELLON, R.; AGUIRRE, J.; SMALE, M.; BERTHAUD, J.; ROSAS, M.; MENDOZA, J.; SOLANO, A.; MARTÍNEZ, R. 2004. Intervenciones participativas para la conservación de maíz en fincas en los Valles Centrales de Oaxaca; México. En: Chávez-Servia, J.L.; Tuxill, J.; Jarvis, D.I. (eds). Manejo de la diversidad de los cultivos en los agroecosistemas tradicionales. Instituto Internacional de recursos fitogenéticos. Cali; Colombia. p.118-123. BRACCO, M.; LIA, V.; POGGIO, L.; CÁMARA, J.; GOTTLIEB, A. 2013. Caracterización genética de razas de maíz autóctonas de Misiones; Argentina. Rev. Cienc. Tecnol. (Argentina). 20:52-60. CHEN, F.B.; YAO, Q.L.; LIU, H.F.; FANG, P. 2016. Evaluation on the germplasm of maize (Zea mays L.) landraces from southwest China. Genet. Mol. Res. (Brasil). 15(4):gmr15049160. EGUIARTE, L.; SOUZA, V.; AGUIRRE, X. 2007. Ecología Molecular. México D.F. México. Impresora y Encuadernadora Progreso. 609p. ELÇI, E.; HANÇER, T. 2015. Genetic analysis of maize (Zea mays L.) hybrids using microsatellite markers. J. Agric. Sci. (Canadá). 21:192-198. http://dx.doi.org/10.15832/tbd.81254 FERNANDES, E.; SCHUSTER, I.; SCAPIM, C.; VIEIRA, E.; COAN, M. 2015. Genetic diversity in elite inbred lines of maize and its association with heterosis. Genet. Mol. Res. (Brasil). 14(2):6509-6517. https://doi.org/10.4238/2015.June.12.3 GÁLVEZ, D.; SALVADOR, M.; BECERRA, E.; GONZÁLEZ, M.; HERNÁNDEZ, S.; MAYEK, N. 2010. Diversidad molecular y relaciones genéticas de germoplasma de mango de Chiapas; México. Agrociencia (México). 44(8):907-915. GONZÁLEZ CASTRO, M.E.; PALACIOS ROJAS, N.; ESPINOZA BANDA, A.; BEDOYA SALAZAR, C.A. 2013. Diversidad genética en maíces nativos mexicanos tropicales. Rev. Fitotecnia Mexicana. 36(3):329-328. GRUPO SEMILLAS. 2007. Aprobado el maíz transgénico en Colombia. Una amenaza a la biodiversidad y la soberanía alimentaria. Revista Semillas 32:21-31. HAMMER, O.; HARPER, D.; RYAN, P. 2001. 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NYALIGWA, L.; HUSSEIN, S.; AMELEWOR, B.; GHEBREHIWO, H. 2015. Genetic diversity analysis of elite maize inbred lines of diverse sources using SSR markers. Maydica (Italia). 60:1-8. PEAKALL, R.; SMOUSE, P. 2006. Genalex 6: Genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research. Mol. Ecol. Notes. (Inglaterra). 6(1):288-295. https://doi.org/10.1111/j.1471-8286.2005.01155.x QIU, S.; CHEN, J.; LIN, S.; LIN, X. 2012. A comparison of silver staining protocols for detecting DNA in polyester backed polyacrylamide gel. Braz. J. Microbiol. (Brasil). 43(2):649-652. http://dx.doi.org/10.1590/S1517-83822012000200029 SALAMI, H.A.; SIKA, K.C.; PADONOU, W.; ALY, D.; YALLOU, C.; ADJANOHOUN, A.; KOTCHONI, S.; BABA-MOUSSA, L. 2016. Genetic diversity of maize accessions (Zea mays L.) cultivated from Benin using microsatellites markers. Amer. J. Mol. Biol. (EEUU). 6:12-24. http://dx.doi.org/10.4236/ajmb.2016.61002 SÁNCHEZ, I.; PÉREZ, E. 2014. Maíz I (Zea mays). Reduca (Biología). 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