Uso de microsatélites para la caracterización molecular de palma de aceite tipo dura
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La palma de aceite llegó a Colombia hacia la década de 1940, con materiales de siembra tipo Dura. Los cruces realizados generaron progenies que fueron establecidas en las diferentes zonas productoras del país. Sin embargo, después de varias décadas, se reconoce que la utilización de dichos genotipos podría haber sido mayor. En consecuencia, Cenipalma estableció actividades conducentes a identificar la mayoría de tales materiales Dura y, sobre lo que se encontró, realizar evaluaciones moleculares para conocer la variabilidad genética de las poblaciones y las relaciones entre los individuos, con el fin de recuperar poblaciones y emplear algunos de los individuos disponibles, como parentales en cruces controlados. Así, en el presente artículo,... Ver más
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Uso de microsatélites para la caracterización molecular de palma de aceite tipo dura Using microsatellites for molecular characterisation of dura oil palm La palma de aceite llegó a Colombia hacia la década de 1940, con materiales de siembra tipo Dura. Los cruces realizados generaron progenies que fueron establecidas en las diferentes zonas productoras del país. Sin embargo, después de varias décadas, se reconoce que la utilización de dichos genotipos podría haber sido mayor. En consecuencia, Cenipalma estableció actividades conducentes a identificar la mayoría de tales materiales Dura y, sobre lo que se encontró, realizar evaluaciones moleculares para conocer la variabilidad genética de las poblaciones y las relaciones entre los individuos, con el fin de recuperar poblaciones y emplear algunos de los individuos disponibles, como parentales en cruces controlados. Así, en el presente artículo, se reportan los resultados de la caracterización molecular, mediante la técnica de amplificación de loci microsatélites, de 80 individuos, correspondientes a 13 poblaciones de palma de aceite tipo Dura. Se concluye que, con base en su similitud genética, dichas poblaciones pueden ser clasificadas en dos grandes grupos y que es posible reconstruir en gran medida las poblaciones originales con los materiales actuales. Además, se encontró que la variabilidad genética entre las poblaciones (interpoblacional) es mayor que la encontrada dentro de cada población (intrapoblacional). The oil palm arrived in Colombia by the 1940?s, with the Dura type as planting material. Breeding-crosses generated progenies that were established in the different oil palm growing regions of the country. However, after several decades, it has been recognized that the use of these genotypes could have been broader. In consequence, Cenipalma established research activities to identify the maximum possible number of such Dura material and, on the resulting palms, to carry out molecular evaluations in order to determine the genetic variability of these populations and the relationship among individuals. This information will be useful in order to renew oil palm populations and to use some of these materials as parental lines in controlled crosses. Thus, in this paper, results are reported on the molecular characterization, using microsatellite-PCR-based technique, of 80 Dura-type oil palm individuals, from 13 populations. Results show that, based on their genetic similarity, these populations can be classified into two major groups and it is possible to recover, in a considerable way, original oil palm populations by using the currently identified materials. In addition, a higher interpopulation genetic variability than intrapopulation variation was found. Rocha Salavarrieta, Pedro Jesús Suárez González, Sandra Rubiela Rey Bolívar, Leonardo Elaeis guineensis Jacq Análisis poblacional PCR Elaeis guineensis Jacq Population analysis PCR 10 2 Núm. 2 , Año 2007 :Revista U.D.C.A Actualidad & Divulgación Científica. Julio-Diciembre Artículo de revista Journal article 2007-12-31T00:00:00Z 2007-12-31T00:00:00Z 2008-12-31 application/pdf text/html Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales U.D.C.A Revista U.D.C.A Actualidad & Divulgación Científica 0123-4226 2619-2551 https://revistas.udca.edu.co/index.php/ruadc/article/view/584 10.31910/rudca.v10.n2.2007.584 https://doi.org/10.31910/rudca.v10.n2.2007.584 spa https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ 51 63 ARIAS, D.; ROCHA, P. 2004. Análisis de diversidad genética en materiales tolerantes y susceptibles a la pudrición de cogollo en palma de aceite mediante marcadores moleculares. Palmas (Colombia). 25(3):11-27. BASTIDAS, S.; PE?A, E.; REYES, R. 2003. Genealogía del germoplasma de palma de aceite (Elaeis guineensis Jacq.) del proyecto de mejoramiento genético de Corpoica. Palmas. 24(1):21-29. BEIRNAERT, A.; VANDERWEYEN, R. 1941. Contribution a l?étude g?nétique et biométrique des variétés d? Elaeis guineensis Jacq. Publ. Inst. Natl. Etude Agron. Congo Belge, Ser. Sci. (Belgium). 27:1-101. BILLOTTE, N.; FRANCES, L; AMBLARD, P.; DURAND-GASSELIN, T. RUSTERUCCI, A.M.; NOYER, J.L.; COURTOIS, B. 2001a. Search for AFLP and microsatellite molecular markers of the SH gene in oil palm (Elaeis guineensis Jacq.) by bulk segregant analysis (BSA) and by genetic mapping. Proceedings of 2001 PIPOC International Palm Oil Congress ? Cutting-edge technologies for sustained competitiveness (Agriculture). Malaysia. p.442-445. BILLOTTE, N.; RUSTERUCCI, A.M.; BARCELOS, E.; NOYER, J.L.; AMBLARD, P.; BAURENS, F.C. 2001b. Development, characterization, and across-taxa utility of oil palm (Elaeis guineensis Jacq.) microsatellite markers. 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Genetics (U.S.A.). 49:725-738. MELÉNDEZ, E. 2006. Caracterización molecular de palma de aceite, Elaeis guineensis Jacq., procedente de Angola mediante microsatélites en Cenipalma. Trabajo de Grado. Universidad Francisco de Paula Santander, Cúcuta. 93p. MONTOYA, C.; ARIAS, D.; REY, L.; ROCHA, P.J. 2005. Diversidad genética de materiales Elaeis guineensis Jacq. procedentes de Angola. Fitotecnia Colombiana. 5(2):1-10. MORETZSOHN, M.C.; NUNES, C.D.M.; FERREIRA, M.F.; GRATTAPAGLIA D. 2000. RAPD linkage mapping of the shell thickness locus in oil palm (Elaeis guineensis Jacq.). Theoret. Appl. Genet. 100:63-70. NEI, M. 1972. Genetic distance between populations. Am. Nat. 106:283-292. NEI, M. 1973. Analysis of gene diversity in subdivided populations. Proc. Nat. Acad. Scienc. 70:3321-3323. REY L.; GÓMEZ P.L.; AYALA I.; DELGADO W.; ROCHA, P. 2004. Colecciones genéticas de palma de aceite Elaeis guineensis (Jacq.) y Elaeis oleifera (H.B.K) de Cenipalma: características de importancia para el sector palmicultor. Palmas. 2(No. Especial):39-48. ROCHA, P.J. 2003. Marcadores moleculares, una herramienta útil para la selección de palma de aceite. Palmas. 24(2):11-25. ROCHA, P.J. 2004. Conceptos básicos en biotecnología de la palma de aceite. Palmas. 25(No. Especial. Tomo 1.):1-17. ROCHA, P.J. 2007. La biotecnología como una herramienta para agilizar la selección de nuevos materiales en palma de aceite. Palmas.28(No. Especial. Tomo 1): 144-148. ROCHA, P.J.; MELÉNDEZ, E.; REY, L. 2007. Ampliación del análisis de diversidad genética de palma de aceite proveniente de Angola. Respuestas (Colombia). 12(1):20-28. ROCHA, P.J.; ROJAS, Y.; REY, L. 2005. Caracterización molecular preliminar del banco de germoplasma de Elaeis oleifera [H.B.K.] Cortés, mediante microsatélites. Ceniavances (Colombia). No. 130:1-4. ROHLF, F.J. 2000. NTSYSpc: Numerical taxonomy and multivariate system. Version 2.1. Exeter Publ. Ltd. Setauket, N.Y. Programa informático. SAITOU, N.; NEI, M. 1987. The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees. Mol. Biol. and Evol. (United Kingdom). 4:406-425. SNEATH, P.H.A.; SOKAL, R.R. 1973. Numerical taxonomy. Freeman, San Francisco, CA. 573p. SUÁREZ, S.R. 2006. Estudio preliminar de la caracterización molecular por microsatélites de progenitores tipo Dura de palma de aceite (Elaeis guineensis Jacq.). Trabajo de Grado. Facultad de Química Industrial. Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales (U.D.C.A) y Corporación Tecnológica de Bogotá (C.T.B.). Bogotá. 90p. WRIGHT, S. 1978. Evolution and the genetics of populations. Vol. 4. Variability within and among natural populations. University of Chicago Press, Chicago, IL. 581p. WRIGHT, S. 1951. The genetical structure of populations. Ann. Eugenics (United Kingdom). 15:323-354. YEH, F.C.; BOYLE, T. 1997. Population genetic analysis of co-dominant and dominant markers and quantitative traits. Belgian J. Bot. (Belgium) 129:157. https://revistas.udca.edu.co/index.php/ruadc/article/download/584/516 https://revistas.udca.edu.co/index.php/ruadc/article/download/584/517 info:eu-repo/semantics/article http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 http://purl.org/coar/resource_type/c_1843 info:eu-repo/semantics/publishedVersion http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 info:eu-repo/semantics/openAccess http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 Text Publication |
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Using microsatellites for molecular characterisation of dura oil palm |
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La palma de aceite llegó a Colombia hacia la década de 1940, con materiales de siembra tipo Dura. Los cruces realizados generaron progenies que fueron establecidas en las diferentes zonas productoras del país. Sin embargo, después de varias décadas, se reconoce que la utilización de dichos genotipos podría haber sido mayor. En consecuencia, Cenipalma estableció actividades conducentes a identificar la mayoría de tales materiales Dura y, sobre lo que se encontró, realizar evaluaciones moleculares para conocer la variabilidad genética de las poblaciones y las relaciones entre los individuos, con el fin de recuperar poblaciones y emplear algunos de los individuos disponibles, como parentales en cruces controlados. Así, en el presente artículo, se reportan los resultados de la caracterización molecular, mediante la técnica de amplificación de loci microsatélites, de 80 individuos, correspondientes a 13 poblaciones de palma de aceite tipo Dura. Se concluye que, con base en su similitud genética, dichas poblaciones pueden ser clasificadas en dos grandes grupos y que es posible reconstruir en gran medida las poblaciones originales con los materiales actuales. Además, se encontró que la variabilidad genética entre las poblaciones (interpoblacional) es mayor que la encontrada dentro de cada población (intrapoblacional).
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The oil palm arrived in Colombia by the 1940?s, with the Dura type as planting material. Breeding-crosses generated progenies that were established in the different oil palm growing regions of the country. However, after several decades, it has been recognized that the use of these genotypes could have been broader. In consequence, Cenipalma established research activities to identify the maximum possible number of such Dura material and, on the resulting palms, to carry out molecular evaluations in order to determine the genetic variability of these populations and the relationship among individuals. This information will be useful in order to renew oil palm populations and to use some of these materials as parental lines in controlled crosses. Thus, in this paper, results are reported on the molecular characterization, using microsatellite-PCR-based technique, of 80 Dura-type oil palm individuals, from 13 populations. Results show that, based on their genetic similarity, these populations can be classified into two major groups and it is possible to recover, in a considerable way, original oil palm populations by using the currently identified materials. In addition, a higher interpopulation genetic variability than intrapopulation variation was found.
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Malaysia. p.442-445. BILLOTTE, N.; RUSTERUCCI, A.M.; BARCELOS, E.; NOYER, J.L.; AMBLARD, P.; BAURENS, F.C. 2001b. Development, characterization, and across-taxa utility of oil palm (Elaeis guineensis Jacq.) microsatellite markers. Genome (Canada). 44(3):413-425. BILLOTTE, N; MARSEILLAC, N; RISTERUCCI, A.M; ADON; B; BROTTIER, P.; BAURENS, F.C.; SINGH, R.; HERRÁN, A.; ASMADY, H.; BILLOT, C.; AMBLARD, P.; DURAN-GASSELIN, T.; COURTOIS, B.; ASMONO, D.; CHEAH, S.C.; ROHDE, W.; RITTER, E.; CHARRIER, A. 2005. Microsatellite-based high density linkage map in oil palm (Elaeis guineensis Jacq.). Theoret. Appl. Genet. (Germany). 110:754-765. CORLEY, R.H.V.; TINKER, P.B. 2003. The oil palm. 4th ed. Blackwell Publ. Great Britain. 562p. FALCONER, D.S. 1981. Introduction to quantitative genetics. 2nd ed. Longman. New York. 340p. FEDEPALMA. 2006. Statistical yearbook 2006. The oil palm agroindustry in Colombia and the World 2001-2005. Fedepalma, Bogotá, 122p. GOWER, J.C. 1966. Some distance properties of latent root and vector methods used in multivariate analysis. Biometrika (United Kingdom). 53:325-338. KIMURA, M.; CROW, J.F. 1964. The number of alleles that can be maintained in a finite population. Genetics (U.S.A.). 49:725-738. MELÉNDEZ, E. 2006. Caracterización molecular de palma de aceite, Elaeis guineensis Jacq., procedente de Angola mediante microsatélites en Cenipalma. Trabajo de Grado. Universidad Francisco de Paula Santander, Cúcuta. 93p. MONTOYA, C.; ARIAS, D.; REY, L.; ROCHA, P.J. 2005. Diversidad genética de materiales Elaeis guineensis Jacq. procedentes de Angola. Fitotecnia Colombiana. 5(2):1-10. MORETZSOHN, M.C.; NUNES, C.D.M.; FERREIRA, M.F.; GRATTAPAGLIA D. 2000. RAPD linkage mapping of the shell thickness locus in oil palm (Elaeis guineensis Jacq.). Theoret. Appl. Genet. 100:63-70. NEI, M. 1972. Genetic distance between populations. Am. Nat. 106:283-292. NEI, M. 1973. Analysis of gene diversity in subdivided populations. Proc. Nat. Acad. 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Caracterización molecular preliminar del banco de germoplasma de Elaeis oleifera [H.B.K.] Cortés, mediante microsatélites. Ceniavances (Colombia). No. 130:1-4. ROHLF, F.J. 2000. NTSYSpc: Numerical taxonomy and multivariate system. Version 2.1. Exeter Publ. Ltd. Setauket, N.Y. Programa informático. SAITOU, N.; NEI, M. 1987. The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees. Mol. Biol. and Evol. (United Kingdom). 4:406-425. SNEATH, P.H.A.; SOKAL, R.R. 1973. Numerical taxonomy. Freeman, San Francisco, CA. 573p. SUÁREZ, S.R. 2006. Estudio preliminar de la caracterización molecular por microsatélites de progenitores tipo Dura de palma de aceite (Elaeis guineensis Jacq.). Trabajo de Grado. Facultad de Química Industrial. Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales (U.D.C.A) y Corporación Tecnológica de Bogotá (C.T.B.). Bogotá. 90p. WRIGHT, S. 1978. Evolution and the genetics of populations. Vol. 4. Variability within and among natural populations. 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