Titulo:
Análisis comparativo de dos protocolos de aislamiento de ADN en hojas secas de mango (Mangifera indica L.) para uso en técnicas moleculares
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Sumario:
La obtención de ADN genómico de alta calidad es fundamental para la preservación de los recursos genéticos, especialmente, en especies de valor importante en la economía popular; sin embargo, la presencia de contaminantes, como polisacáridos, polifenoles y metabolitos secundarios en árboles frutales, dificulta la extracción de ADN puro. En este trabajo, se compararon dos métodos de extracción de ADN en tejido seco: un kit comercial y el método modificado de Doyle & Doyle. La cantidad y calidad del ADN extraído se evaluaron utilizando un espectrofotómetro y mediante electroforesis en gel de agarosa. Es importante señalar que el ADN obtenido con el kit comercial mostró presencia de compuestos aromáticos y proteínas, mientras que e... Ver más
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0123-4226
2619-2551
27
2025-12-31
Enrique Pardo-Pérez, Leandro Anaya-Palmera, Teodora Cavadía-Martínez - 2024
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Comparative analysis of two DNA isolation protocols in dried leaves of mango (Mangifera indica L.) for use in molecular techniques |
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La obtención de ADN genómico de alta calidad es fundamental para la preservación de los recursos genéticos, especialmente, en especies de valor importante en la economía popular; sin embargo, la presencia de contaminantes, como polisacáridos, polifenoles y metabolitos secundarios en árboles frutales, dificulta la extracción de ADN puro. En este trabajo, se compararon dos métodos de extracción de ADN en tejido seco: un kit comercial y el método modificado de Doyle & Doyle. La cantidad y calidad del ADN extraído se evaluaron utilizando un espectrofotómetro y mediante electroforesis en gel de agarosa. Es importante señalar que el ADN obtenido con el kit comercial mostró presencia de compuestos aromáticos y proteínas, mientras que el método modificado de Doyle y Doyle logró obtener ADN de alta calidad, sin contaminantes, lo cual, se corroboró por la posterior amplificación, mediante PCR del ADN obtenido con cebadores SSR, mostrando bandas nítidas y bien definidas.
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The extraction of high-quality genomic DNA is essential for the preservation of genetic resources, particularly in species of significant value to the popular economy. However, the presence of contaminants such as polysaccharides, polyphenols, and secondary metabolites in fruit trees complicates the extraction of pure DNA. In this study, two DNA extraction methods in dried tissue were compared: a commercial kit and the modified Doyle & Doyle method. The quantity and quality of the extracted DNA were assessed using a spectrophotometer and agarose gel electrophoresis. It is important to note that the DNA obtained with the commercial kit showed the presence of aromatic compounds and proteins, while the modified Doyle & Doyle method successfully yielded high-quality, contaminant-free DNA, as confirmed by subsequent PCR amplification using SSR primers, which showed clear and well-defined bands.
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ASHA, K.I.; ASWANI S.A.; KRISHNA RADHIKA N.; PRAKASH KRISHNAN, B.S. 2023. Genetic variability and diversity analysis of Chinese potato (Solenostemon rotundifolius (poir.) J. K. Morton) germplasm using morphological and molecular markers. South African Journal of Botany. 155:171-177. https://doi.org/10.1016/j.sajb.2023.02.014 AVALOS, A.; PEREZ-URRIA, E. 2009. Metabolismo secundario de plantas. Reduca (Biología). Serie Fisiología Vegetal. 2(3):119-145. AZMAT, M.A.; KHAN, I.A.; CHEEMA, H.M.N.; RAJWANA, I.A.; KHAN, A.S.; KHAN, A.A. 2012. Extraction of DNA suitable for PCR applications from mature leaves of Mangifera indica L. Journal of Zhejiang University: Science B. 13(4):239-243. http://dx.doi.org/10.1631/jzus.B1100194 BRONDMANN, P. 2008. DNA extraction from different matrices. Molecular Biology Methods for Traceability Purposes, BfR Berlin, Germany, pp. 18-19. CARRILLO-TOMALÁ, C.; DÍAZ-TORRES, R.; GUERRA-GUAMÁN, K.; ROMÁN-SALMERÓN, A. 2020. 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Revista U.D.C.A Actualidad & Divulgación Científica. 24(1):e1504. https://doi.org/10.31910/rudca.v24.n1.2021.1504 PÉREZ, I.; ANGULO, L.; OSORIO, G.; RAMIS, C.; BEDOYA, A.M., FIGUEROA, R.; MOLINA, S.; INFANTE, D. 2011. Método modificado de obtención de ADN genómico en orquídeas (Cattleya spp.): para amplificación con marcadores moleculares. Bioagro. 23:(1)27-34. POMMER, C.V.; MURAKAMI, K.R.N. 2009. Breeding Guava (Psidium guajava L.). En: Jain, S.M.; Priyadarshan, P.M. (eds). Breeding plantation tree crops: Tropical species. Springer. Estados Unidos. pp.83-120 https://doi.org/10.1007/978-0-387-71201-7_3 RAVISHANKAR, K.V.P.; BELLAM, H.R.M.; LALITHA, A.; MAKKI, R.D. 2011. Development of new microsatellite markers from mango (Mangifera indica) and cross‐species amplification. American Journal of Botany. 98(4):e96-e99. https://doi.org/10.3732/ajb.1000263 RILEY, I.J.; DIBATTISTA, J.D.; STEWART, J.; SCHILLING, H.T.; SUTHERS, I.M. 2023. 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Es importante señalar que el ADN obtenido con el kit comercial mostró presencia de compuestos aromáticos y proteínas, mientras que el método modificado de Doyle y Doyle logró obtener ADN de alta calidad, sin contaminantes, lo cual, se corroboró por la posterior amplificación, mediante PCR del ADN obtenido con cebadores SSR, mostrando bandas nítidas y bien definidas. The extraction of high-quality genomic DNA is essential for the preservation of genetic resources, particularly in species of significant value to the popular economy. However, the presence of contaminants such as polysaccharides, polyphenols, and secondary metabolites in fruit trees complicates the extraction of pure DNA. In this study, two DNA extraction methods in dried tissue were compared: a commercial kit and the modified Doyle & Doyle method. The quantity and quality of the extracted DNA were assessed using a spectrophotometer and agarose gel electrophoresis. It is important to note that the DNA obtained with the commercial kit showed the presence of aromatic compounds and proteins, while the modified Doyle & Doyle method successfully yielded high-quality, contaminant-free DNA, as confirmed by subsequent PCR amplification using SSR primers, which showed clear and well-defined bands. Pardo-Pérez, Enrique Anaya-Palmera, Leandro Cavadía-Martínez, Teodora Árboles frutales Extracción de ADN Diversidad genética Preservación de recursos genéticos Técnicas moleculares DNA extraction Fruit trees Genetic diversity Molecular techniques Preservation of genetic resources 27 2 Núm. 2 , Año 2024 :Revista U.D.C.A Actualidad & Divulgación Científica. 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